59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0931 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
346 aa  715    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  40.95 
 
 
319 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  36.33 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  33.01 
 
 
325 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  31.19 
 
 
319 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  30.99 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  31.77 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  33.22 
 
 
321 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  32.5 
 
 
333 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  29.69 
 
 
330 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  30.77 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  32.12 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  30.53 
 
 
333 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  32.9 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  32.28 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  30.17 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  30.84 
 
 
325 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  28.06 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  29.97 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  31.13 
 
 
325 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  30.5 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  30.57 
 
 
321 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  29.25 
 
 
329 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  31.8 
 
 
320 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  30.74 
 
 
339 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  29.74 
 
 
320 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  28.14 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  30.32 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  28.8 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  28.57 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  27.78 
 
 
325 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  28.86 
 
 
352 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  27.5 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  29.93 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  28.93 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  26.22 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  29.49 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  27.56 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  27 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  25 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  26.35 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  26.13 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  21.92 
 
 
441 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  26.86 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  25 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  23.13 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.56 
 
 
662 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.9 
 
 
668 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.47 
 
 
644 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  22.22 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  23.73 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.26 
 
 
654 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.1 
 
 
646 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  23.16 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4056  Acetyl xylan esterase  24.53 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  21.17 
 
 
384 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.41 
 
 
652 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  23.16 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.58 
 
 
644 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>