71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3063 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 320 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  43.32 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  44.92 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  43.65 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  44.92 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  40.52 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  40.66 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  42.76 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  41.53 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  41.83 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  40 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  40.33 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  40.58 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  39.74 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  41.04 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  40 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  39.88 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  38.87 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  41.75 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  36.75 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  38.74 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  39.94 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  36.14 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  34.7 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  34.94 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  35.9 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  36.48 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  38.65 
 
 		 419 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  36.77 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  36.18 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  37.27 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  33.13 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  34.26 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  32.78 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  34.97 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  33.97 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  28.53 
 
 		 432 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  29.34 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  29.74 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  29.51 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  27.4 
 
 		 430 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  28.43 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  25.43 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  26.47 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  27.87 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  23.88 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.52 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  27.37 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.5 
 
 		 667 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.46 
 
 		 666 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  31.34 
 
 		 632 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.05 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.35 
 
 		 750 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.48 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3664  hypothetical protein  28.9 
 
 		 669 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0677  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6283  Acylaminoacyl-peptidase  29.61 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0745769  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.81 
 
 		 664 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  50 
 
 		 651 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  22.95 
 
 		 685 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.97 
 
 		 665 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  30.57 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3747  dienelactone hydrolase  23.58 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.33 
 
 		 632 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  28.78 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.33 
 
 		 463 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  23.75 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  25.95 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.44 
 
 		 474 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.61 
 
 		 617 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3562  dienelactone hydrolase  23.58 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>