21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2440 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
319 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  88.09 
 
 
319 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  57.46 
 
 
317 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  44.3 
 
 
330 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  38.18 
 
 
340 aa  175  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4056  Acetyl xylan esterase  43.81 
 
 
331 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  25.52 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  26.86 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  24.29 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  23.95 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  23.93 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  22.92 
 
 
328 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  23.28 
 
 
325 aa  49.3  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  28.38 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  23.83 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  23.32 
 
 
324 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  26.56 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  21.64 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  24.92 
 
 
432 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  23.78 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  23.05 
 
 
325 aa  42.4  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>