45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1236 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 432 aa  890    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  64.9 
 
 		 441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  46.6 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  33.16 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  30.74 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  28.66 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  29.77 
 
 		 325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  29.73 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  28.53 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  27.3 
 
 		 324 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  25.88 
 
 		 321 aa  96.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  24.1 
 
 		 319 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  25.47 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  28.57 
 
 		 322 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  27.36 
 
 		 324 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  28.76 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  26.99 
 
 		 319 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  29.77 
 
 		 328 aa  89.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  25.32 
 
 		 325 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  25.48 
 
 		 325 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  26.2 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  30.21 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  28.85 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  30.31 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  33.11 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  33.14 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  33.33 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  25.24 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  26.03 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  32.88 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  24.92 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  32.9 
 
 		 325 aa  76.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  23.85 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  28.08 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  29.12 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  31.05 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  25 
 
 		 346 aa  69.7  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  27.69 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  32.53 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  32.19 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  27.38 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  27.84 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  23.15 
 
 		 340 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  23.65 
 
 		 319 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  24.92 
 
 		 319 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>