85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1828 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 320 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  49.03 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  46.08 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  45.42 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  46.86 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  48.4 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  45.48 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  48.15 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  44.58 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  48.73 
 
 		 333 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  44.3 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  45.03 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  43.08 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  43.59 
 
 		 321 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  46.3 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  47.08 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  44.55 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  46.33 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  41.21 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  46.55 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  38.46 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  44.59 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  46.13 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  43.83 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  48.06 
 
 		 329 aa  212  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  47.7 
 
 		 419 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  40.4 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  47.04 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  39.23 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  40.72 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  37.27 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  32.6 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  36.04 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  33.99 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  31.54 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  31.48 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  33.75 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  29.61 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  32.53 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  29.94 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  31.71 
 
 		 454 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  27.72 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  30.05 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.93 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  27.21 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  23.08 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  27.27 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.24 
 
 		 641 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  23.7 
 
 		 681 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  29.45 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.18 
 
 		 615 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  28.25 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.71 
 
 		 636 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.63 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.36 
 
 		 678 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.58 
 
 		 632 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  27.91 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.8 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  24.73 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  28.68 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  24.83 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  26.45 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.12 
 
 		 571 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  29.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  21.32 
 
 		 570 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.66 
 
 		 665 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  27.7 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  26.58 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 		 645 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  26.17 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.9 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  27.17 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  21.3 
 
 		 652 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25.49 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.81 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.81 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.81 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25.81 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.81 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.12 
 
 		 704 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 		 629 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  27.4 
 
 		 618 aa  42.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.89 
 
 		 642 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>