45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3413 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 332 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  53.51 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  49.7 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  49.4 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  49.55 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  49.11 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  50.76 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  48.12 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  50.3 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  50.91 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  50.45 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  51.2 
 
 		 365 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  46.73 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  49.09 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  46.43 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  51.65 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  48.39 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  49.22 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  49.85 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  49.24 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  45.76 
 
 		 350 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  47.76 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  45.95 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  49.7 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  46.85 
 
 		 329 aa  245  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  50.61 
 
 		 419 aa  242  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  46.5 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  48.2 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  37.03 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  46.33 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  40.18 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  37.7 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  33 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  32.53 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.93 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  29.73 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.69 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  30.17 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  30.31 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  28.72 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  28.22 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  28.32 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.62 
 
 		 614 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  29.12 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  26.52 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>