41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2403 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  46.15 
 
 
365 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  48.12 
 
 
350 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  47.83 
 
 
333 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  44.13 
 
 
323 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  43.33 
 
 
324 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  45.09 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  38.67 
 
 
324 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  41.04 
 
 
322 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  39.53 
 
 
325 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  39.34 
 
 
328 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  44.52 
 
 
327 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  37.09 
 
 
329 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  40.67 
 
 
321 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  42.53 
 
 
329 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  41.72 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  40.72 
 
 
321 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  37.75 
 
 
325 aa  195  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  41.84 
 
 
328 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  37.75 
 
 
325 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  39.81 
 
 
339 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  38.12 
 
 
343 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  39.53 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  41.06 
 
 
419 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  39.74 
 
 
332 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  35.95 
 
 
326 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  37.7 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  36.89 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  38.49 
 
 
330 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  39.8 
 
 
352 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  36.04 
 
 
320 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  30.07 
 
 
333 aa  99  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  29.51 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  30.22 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  26.69 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  27.56 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  26.1 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  24.71 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  27.38 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  29.13 
 
 
430 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.28 
 
 
441 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>