65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1462 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  100 
 
 
419 aa  840    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  56.04 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  52.65 
 
 
328 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  53.73 
 
 
324 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  51.54 
 
 
325 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  55.84 
 
 
324 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  54.83 
 
 
323 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  51.85 
 
 
325 aa  332  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  52.63 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  56.37 
 
 
321 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  53.42 
 
 
321 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  54.26 
 
 
324 aa  329  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  53.82 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  53.29 
 
 
325 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  57.28 
 
 
365 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  53.11 
 
 
322 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  48.82 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  50.45 
 
 
332 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  50.46 
 
 
328 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  52.37 
 
 
328 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  51.45 
 
 
330 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  43.08 
 
 
326 aa  280  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  49.38 
 
 
329 aa  272  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  50.61 
 
 
332 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  53.8 
 
 
327 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  44.41 
 
 
343 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  48.68 
 
 
325 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  44.94 
 
 
339 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  48.04 
 
 
352 aa  259  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  41.06 
 
 
309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  47.7 
 
 
320 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  40.06 
 
 
320 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  34.44 
 
 
333 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  31.7 
 
 
319 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  31.94 
 
 
321 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  30.67 
 
 
319 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  31.25 
 
 
325 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  30.35 
 
 
346 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  27.14 
 
 
441 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  27.91 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  26.98 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  31.43 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  28.35 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.97 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.51 
 
 
646 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  24.92 
 
 
313 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.97 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.27 
 
 
298 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.84 
 
 
650 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  28.74 
 
 
735 aa  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  24.84 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.94 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  28.28 
 
 
681 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1356  hypothetical protein  24.86 
 
 
439 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.2 
 
 
668 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  29.86 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.47 
 
 
626 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.46 
 
 
644 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.46 
 
 
644 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.17 
 
 
626 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.08 
 
 
655 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.47 
 
 
626 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.75 
 
 
298 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
302 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>