29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0930 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  100 
 
 		 313 aa  632  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  26.22 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  23.38 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  25.81 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  23.26 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  24.47 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  22.97 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  23.57 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  22.82 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  22.66 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  36.25 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  22.87 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  23.34 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  25.99 
 
 		 365 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  24.48 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  21.31 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  24.02 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  23.56 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  23.24 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  22.6 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  39.66 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  22.42 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  23.47 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  25 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  23.57 
 
 		 454 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  23.97 
 
 		 328 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  36.71 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  29.63 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  23.15 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>