65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0210 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
319 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  61.32 
 
 
321 aa  434  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  48.59 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  39.87 
 
 
325 aa  248  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  40.95 
 
 
346 aa  238  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  33.44 
 
 
324 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  34.29 
 
 
325 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  33.23 
 
 
325 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  33.97 
 
 
325 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  29.52 
 
 
333 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  32.03 
 
 
328 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  32.53 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  32.3 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  34.58 
 
 
333 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  31.53 
 
 
365 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  34.7 
 
 
320 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  30.94 
 
 
321 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  32.7 
 
 
329 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  32.8 
 
 
324 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  33 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  30.75 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  29.9 
 
 
325 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  29.74 
 
 
332 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  33.44 
 
 
328 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  31.05 
 
 
419 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  32.6 
 
 
320 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  29.18 
 
 
343 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  31.06 
 
 
330 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  31.86 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  30.41 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  29.68 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  27.51 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  29.77 
 
 
339 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  32.05 
 
 
327 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  28.7 
 
 
352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  29.56 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  24.1 
 
 
432 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  24.13 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  26.69 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  25.81 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  25.17 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  24.85 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.78 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.67 
 
 
723 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  27.07 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.16 
 
 
669 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.26 
 
 
688 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.63 
 
 
615 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 
634 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.08 
 
 
678 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.72 
 
 
646 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  22.61 
 
 
648 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  27.04 
 
 
750 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1930  hypothetical protein  21.95 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.173781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.47 
 
 
678 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.1 
 
 
620 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.86 
 
 
652 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  29.66 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.06 
 
 
709 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  26.69 
 
 
632 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6283  Acylaminoacyl-peptidase  24.23 
 
 
641 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0745769  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  27.5 
 
 
697 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  23.38 
 
 
259 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  27.69 
 
 
1010 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>