61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1965 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  100 
 
 
321 aa  656    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  68.12 
 
 
332 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  59.32 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  60.12 
 
 
324 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  56.56 
 
 
324 aa  391  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  60.94 
 
 
321 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  56.88 
 
 
325 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  59.38 
 
 
324 aa  381  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  56.88 
 
 
325 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  54.83 
 
 
329 aa  364  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  55.88 
 
 
325 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  54.1 
 
 
333 aa  342  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  56.54 
 
 
323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  53.27 
 
 
365 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  53.75 
 
 
322 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  51.54 
 
 
328 aa  322  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  52.13 
 
 
330 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  52.32 
 
 
324 aa  316  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  52.48 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  51.51 
 
 
350 aa  309  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  48.68 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  48.07 
 
 
339 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  53.42 
 
 
419 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  45.08 
 
 
326 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  49.09 
 
 
332 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  48.37 
 
 
328 aa  271  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  51.58 
 
 
329 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  46.43 
 
 
352 aa  258  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  48.25 
 
 
327 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  43.59 
 
 
320 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  40.67 
 
 
309 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  42.76 
 
 
320 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  30.94 
 
 
319 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.89 
 
 
333 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  32.14 
 
 
321 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.22 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  33.22 
 
 
346 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  29.04 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.13 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  25.95 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  28.35 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  23.85 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.27 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  27.07 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  27.57 
 
 
340 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  28.93 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  23.15 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  30.38 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.43 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.27 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.93 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.9 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  29.53 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.3 
 
 
650 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  24.75 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  30.65 
 
 
346 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  32.54 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>