41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2302 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
454 aa  928    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  48.89 
 
 
441 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  46.6 
 
 
432 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  35.35 
 
 
430 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  28.34 
 
 
325 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  27.69 
 
 
325 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  27.97 
 
 
329 aa  97.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  29.03 
 
 
324 aa  94  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  29.3 
 
 
324 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  28.72 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  27.61 
 
 
325 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  26.59 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  25.64 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  28.99 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  28.43 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  28.3 
 
 
330 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  27.48 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  26.51 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  28.35 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  27 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  28.52 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  27.24 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  26.1 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  26.84 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  25.5 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  25.37 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  24.58 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  26.16 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  27.67 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  24.84 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  25.17 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  25.71 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  26.28 
 
 
350 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  26.98 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  27.67 
 
 
352 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  24.4 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  26.06 
 
 
327 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  24.92 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  23.57 
 
 
313 aa  46.6  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  31.71 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.31 
 
 
381 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>