63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1984 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
327 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  62.42 
 
 
365 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  56.77 
 
 
350 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  53.77 
 
 
323 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  53.52 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  55.76 
 
 
329 aa  317  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  49.54 
 
 
329 aa  308  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  51.7 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  47.95 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  50.31 
 
 
324 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  51.63 
 
 
325 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  49.53 
 
 
322 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  47.27 
 
 
325 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  46.83 
 
 
325 aa  291  8e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  49.21 
 
 
321 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  46.56 
 
 
324 aa  289  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  50.16 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  53.8 
 
 
419 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  48.57 
 
 
332 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  51.1 
 
 
328 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  48.7 
 
 
352 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  47.11 
 
 
330 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  48.2 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  44.89 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  40.24 
 
 
326 aa  251  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  44.48 
 
 
339 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  43.36 
 
 
343 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  44.52 
 
 
309 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  47.04 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  34.97 
 
 
320 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  32.05 
 
 
319 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.37 
 
 
333 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  31.07 
 
 
321 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  30.69 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  26.64 
 
 
319 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  29.6 
 
 
346 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  25.46 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  32.19 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  27.33 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  25.25 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  26.91 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  27.38 
 
 
330 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.95 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  22.8 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  24.07 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.29 
 
 
646 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  22.83 
 
 
652 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  27.22 
 
 
292 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.04 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.77 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.19 
 
 
402 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.18 
 
 
644 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.18 
 
 
644 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  27.78 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.19 
 
 
655 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.74 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  22.98 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0599  hypothetical protein  29.38 
 
 
651 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  24.81 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  24.53 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  26.28 
 
 
306 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>