47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  100 
 
 		 330 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  56.63 
 
 		 324 aa  361  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  57.4 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  54.29 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  55.83 
 
 		 322 aa  348  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  55.15 
 
 		 321 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  51.98 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  52.29 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  50.46 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  49.09 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  49.09 
 
 		 325 aa  323  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  52.47 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  51.91 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  48.64 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  53.09 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  48.64 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  49.25 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  47.43 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  48.55 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  47.9 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  48.44 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  47.29 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  51.45 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  48.66 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  46.25 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  47.69 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  48.64 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  40.24 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  47.42 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  44.85 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  38.17 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  39.94 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  32.61 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  33.02 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  31.23 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  30.97 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.71 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  29.03 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  33.14 
 
 		 432 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  28.3 
 
 		 454 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.1 
 
 		 441 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  28.42 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  25.84 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  27.78 
 
 		 340 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  29.38 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  25.69 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  28.09 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>