54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2720 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  100 
 
 
332 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  68.12 
 
 
321 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  56.56 
 
 
328 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  55.31 
 
 
325 aa  368  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  55.31 
 
 
325 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  52.5 
 
 
324 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  52.62 
 
 
329 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  53.73 
 
 
324 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  56.39 
 
 
321 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  54.72 
 
 
324 aa  329  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  52.32 
 
 
324 aa  309  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  51.82 
 
 
333 aa  308  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  54.49 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  51.27 
 
 
322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  53.59 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  48.77 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  52.47 
 
 
330 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  51.41 
 
 
325 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  49.85 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  46.18 
 
 
343 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  44.17 
 
 
326 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  47.25 
 
 
350 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  50.45 
 
 
419 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  49.06 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  44.35 
 
 
339 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  49.24 
 
 
332 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  46.13 
 
 
352 aa  255  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  46.56 
 
 
329 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  47.94 
 
 
327 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  41.53 
 
 
320 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  44.59 
 
 
320 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  39.74 
 
 
309 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  29.74 
 
 
319 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.1 
 
 
333 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  30.32 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  32.9 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  26.81 
 
 
325 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  26.49 
 
 
319 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  27.59 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  26.69 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  26.03 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  26.1 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  29.37 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.36 
 
 
402 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  22.6 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.22 
 
 
298 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  26.24 
 
 
319 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.63 
 
 
656 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  25.36 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.85 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  23.39 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
661 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.64 
 
 
645 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>