47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1761 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
324 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  60.06 
 
 
333 aa  374  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  59.26 
 
 
323 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  55.42 
 
 
325 aa  352  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  55.11 
 
 
325 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  55.56 
 
 
324 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  54.32 
 
 
324 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  55.56 
 
 
365 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  56 
 
 
322 aa  339  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  53.87 
 
 
350 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  54.71 
 
 
328 aa  335  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  52.83 
 
 
328 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  54.35 
 
 
324 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  52.48 
 
 
321 aa  332  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  52.45 
 
 
329 aa  331  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  57.01 
 
 
321 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  52.97 
 
 
352 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  52.63 
 
 
332 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  51.33 
 
 
339 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  50.31 
 
 
325 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  50.15 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  53.25 
 
 
328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  54.26 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  46.18 
 
 
326 aa  290  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  50.3 
 
 
332 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  53.19 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  49.54 
 
 
325 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  51.7 
 
 
327 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  46.22 
 
 
330 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  46.3 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  41.72 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  41.37 
 
 
320 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  33.12 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  34.11 
 
 
333 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  32.26 
 
 
321 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  27.22 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.41 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  28.8 
 
 
346 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.92 
 
 
441 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  26.73 
 
 
432 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  25.58 
 
 
454 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  25.45 
 
 
430 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  28.16 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  28.1 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  24.7 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  28.05 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  24.91 
 
 
632 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>