95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4187 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
328 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  51.55 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  53.42 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  55.59 
 
 
333 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  49.69 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  55.11 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  49.69 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  54.94 
 
 
322 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  53.42 
 
 
321 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  50.61 
 
 
329 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  53.99 
 
 
365 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  49.21 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  53.46 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  50.62 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  53.25 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  46.95 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  48.37 
 
 
321 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  49.37 
 
 
332 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  47.52 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
325 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  52.89 
 
 
329 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  48.55 
 
 
350 aa  272  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  52.37 
 
 
419 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  42.81 
 
 
326 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  50.6 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  47.69 
 
 
330 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  46.61 
 
 
339 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  46.72 
 
 
352 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  51.26 
 
 
327 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  41.84 
 
 
309 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  46.13 
 
 
320 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  36.18 
 
 
320 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  29.68 
 
 
319 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  31.06 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  31.41 
 
 
321 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.45 
 
 
325 aa  119  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  28.52 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  29.49 
 
 
346 aa  95.9  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  25.95 
 
 
441 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  28.08 
 
 
432 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  26.11 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  30.99 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  25.47 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  24.01 
 
 
454 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.26 
 
 
646 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  27.12 
 
 
301 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  32.03 
 
 
662 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  28.93 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  28.29 
 
 
298 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.68 
 
 
661 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
661 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
662 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  27.06 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
662 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  27.85 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  26.94 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
662 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  30.86 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  27.98 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  27.08 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.27 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  30.86 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.54 
 
 
474 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.37 
 
 
662 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.88 
 
 
662 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.97 
 
 
653 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  30.72 
 
 
649 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
295 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
295 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.72 
 
 
657 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.12 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.85 
 
 
309 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.56 
 
 
659 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  32.14 
 
 
262 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  30.43 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  28.76 
 
 
653 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.1 
 
 
646 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.73 
 
 
621 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.05 
 
 
720 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  25 
 
 
735 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  21.89 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.48 
 
 
615 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
654 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  30.12 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 
690 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  27.78 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.38 
 
 
605 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.58 
 
 
698 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.71 
 
 
654 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6283  Acylaminoacyl-peptidase  25.95 
 
 
641 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0745769  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  26.22 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.77 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  29.49 
 
 
667 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  34.19 
 
 
304 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.52 
 
 
682 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>