36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5838 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
330 aa  661    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  44.3 
 
 
319 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  42.9 
 
 
319 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  42.54 
 
 
317 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  47.12 
 
 
340 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4056  Acetyl xylan esterase  45.66 
 
 
331 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  27.74 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  26.44 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  26.96 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  28.34 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  25.76 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  24.32 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  28.57 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  27.42 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  28.84 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  25.84 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  28.35 
 
 
419 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  26.6 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  26.33 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  27.46 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  27.63 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  27.07 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  19.4 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  26.15 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  28.1 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  23.45 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  21.81 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  25 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  20.95 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  26.39 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  20.7 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  27.15 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  25.36 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  38.46 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  26.17 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  26.52 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>