More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6451 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  95.25 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  57.73 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  54.95 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  55.33 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  53.9 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  51.71 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  50.5 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  43.64 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  42.18 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  44.37 
 
 		 308 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  40.4 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  36.82 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 321 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  35.1 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  37.09 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  33.67 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  37.59 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  37.09 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  34.46 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  36.65 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  35.46 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  34.75 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  33.92 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  35.46 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  43.36 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  34.52 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  34.66 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.78 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  33.45 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  29.03 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  30.84 
 
 		 467 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  27.24 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  27.46 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  25.15 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.09 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  36.72 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  26.44 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  31.62 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  28.93 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  28.3 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  28.3 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.3 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  27.67 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  27.67 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  23.55 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  24.1 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  28.87 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.24 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  29.71 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  33.61 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  36.22 
 
 		 1010 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  33.86 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  32.82 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  34.43 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  34.39 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  33.58 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.58 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  32.58 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  26.4 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.61 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.58 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  30.77 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.01 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  24.5 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.47 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  28.15 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.65 
 
 		 876 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  27.43 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 868 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  24.32 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  29.01 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>