144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5082 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
321 aa  648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  38.38 
 
 
295 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  37.71 
 
 
295 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  37.13 
 
 
306 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  36.16 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  39.6 
 
 
308 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  37.08 
 
 
315 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
314 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  34.45 
 
 
316 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  37.04 
 
 
295 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 
312 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
316 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
295 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  35.88 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  37.55 
 
 
315 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  37.25 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
297 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
305 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
313 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
313 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
313 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  30.39 
 
 
301 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  31.85 
 
 
311 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  25.9 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  28.24 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  27.92 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  29.05 
 
 
298 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  28.83 
 
 
298 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 
304 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  28.91 
 
 
292 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  30.74 
 
 
321 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.82 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  29.67 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  29.01 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.32 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  26.85 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.14 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  27.67 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  41.28 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  26.98 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  32.26 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.91 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  26.56 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  28.5 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  29.79 
 
 
301 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  31.37 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  29.86 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  34.41 
 
 
132 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  28.49 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  30.15 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  31.11 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.83 
 
 
424 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  31.58 
 
 
368 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.49 
 
 
448 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  30.1 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  34.78 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  27.59 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  30.1 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  30.77 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.74 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  27.4 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  29.05 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  30.77 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  32.67 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  26.19 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  26.21 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  28.47 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  29.53 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  32.67 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  31.15 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  32.67 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  32.67 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  26.71 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  29 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  37.78 
 
 
561 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  28.04 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  26.98 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  28.78 
 
 
348 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  32.67 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  32.67 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  32.65 
 
 
532 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.66 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  32.61 
 
 
378 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  30.49 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  30.47 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  29.03 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  31.68 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  34.65 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>