More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3008 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 295 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 295 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 297 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  42.28 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  38.65 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  38.7 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  39.04 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  41.97 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  37.8 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  41.23 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  34.83 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  34.83 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  36.57 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  37.08 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  35.14 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  40.2 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  32.76 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  35.69 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  32.65 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  31.74 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  32.75 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.26 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  31.27 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.21 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  29.15 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  35.46 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30.66 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  29.29 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.17 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.15 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  35.33 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  30.74 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  31.13 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.72 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  40 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  33.09 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 868 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  32.87 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  40.59 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  32.28 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  31.36 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.76 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.33 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  29.45 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  34.13 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.25 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  30.04 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  29.48 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  39.08 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  28.14 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  29.93 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  36.5 
 
 		 424 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.76 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.89 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  33.33 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  32.54 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.54 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.54 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  29.93 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.51 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.54 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  30.15 
 
 		 1010 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.54 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.54 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  35 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  35.37 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  35.92 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  35 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  28.22 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  33.61 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  32.06 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  27.89 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.79 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  26.58 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  32.86 
 
 		 681 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  37.89 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  23.19 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  29.56 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  27.8 
 
 		 866 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>