45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0486 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
430 aa  882    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  35.35 
 
 
454 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  31.26 
 
 
441 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  33.16 
 
 
432 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  30.6 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  25.68 
 
 
325 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  25.68 
 
 
325 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  28.47 
 
 
328 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  28.15 
 
 
324 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  27.76 
 
 
324 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  25.64 
 
 
329 aa  87  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  26.32 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  29.62 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  27.4 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  26.69 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  25.95 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  28.77 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  25.15 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  34.75 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  26.83 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  23.23 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  27.97 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  25.09 
 
 
324 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  28.32 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  26.64 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  26.11 
 
 
328 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  27.98 
 
 
326 aa  64.3  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
365 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  33.08 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  32.58 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  28.09 
 
 
333 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  24.85 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  26.63 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  25.78 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  25.8 
 
 
319 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  22.11 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  35.42 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  29.13 
 
 
309 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  23.17 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  24.04 
 
 
352 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  42.86 
 
 
320 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  32.39 
 
 
327 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  28.89 
 
 
245 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  22.22 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  20.4 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>