22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1356 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1356  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  907    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3217  hypothetical protein  39.82 
 
 		 454 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6614  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein PqaA type  39.19 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1682  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  39.71 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.636927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1797  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  35.52 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1834  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  36.22 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01585  PhoPQ-regulated protein  28.82 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0207412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5043  hypothetical protein  27.45 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1626  PqaA protein  25.94 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4917  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  27.45 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1648  PqaA protein  25.71 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439725  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1792  PqaA protein  24.79 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1656  PqaA protein  25.47 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1715  PqaA protein  25 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0123  PqaA protein  26.99 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1596  hypothetical protein  26.99 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0147  PqaA protein  26.99 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0113  PqaA  28.06 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05517  putative transmembrane protein  26.65 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3028  hypothetical protein  24.68 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2286  hypothetical protein  21.11 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2842  hypothetical protein  20.74 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>