105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4236 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3337  hypothetical protein  54.82 
 
 
342 aa  332  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  45.99 
 
 
710 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2527  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  41.45 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  33.21 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  32.83 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0917  putative aminopeptidase protein  34.3 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0248171  normal  0.161085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  37.4 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
642 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  32.28 
 
 
735 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  32.82 
 
 
741 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.52 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1306  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.65 
 
 
651 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.96 
 
 
574 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  36.89 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2710  hypothetical protein  38.14 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000170279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.89 
 
 
608 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.89 
 
 
667 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.15 
 
 
645 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  35.9 
 
 
256 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.42 
 
 
664 aa  49.7  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  33.1 
 
 
283 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 
666 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  26.2 
 
 
665 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  38 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  27.27 
 
 
612 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  31.06 
 
 
763 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.03 
 
 
607 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  25.79 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 
607 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.33 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.15 
 
 
246 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.82 
 
 
644 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.56 
 
 
750 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
607 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.94 
 
 
771 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.94 
 
 
766 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0717  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.36 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  35.71 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.3 
 
 
760 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  36.04 
 
 
254 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  29.37 
 
 
662 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  30.11 
 
 
288 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.34 
 
 
660 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  29.41 
 
 
665 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.88 
 
 
648 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  24.39 
 
 
688 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  29.01 
 
 
752 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  29.93 
 
 
775 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  30.22 
 
 
763 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  30.22 
 
 
763 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  30.22 
 
 
763 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.08 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  24.02 
 
 
425 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.06 
 
 
662 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  25.53 
 
 
648 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.47 
 
 
655 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  23.66 
 
 
655 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.97 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.99 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.22 
 
 
767 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.25 
 
 
634 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  24.53 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.53 
 
 
655 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.88 
 
 
631 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  24.53 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  22.12 
 
 
698 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  31.71 
 
 
423 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.66 
 
 
634 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  31.71 
 
 
423 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.12 
 
 
662 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 
644 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.34 
 
 
768 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.22 
 
 
771 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0189  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.14 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.399417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 
644 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  31.54 
 
 
765 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.46 
 
 
668 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.46 
 
 
646 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  29.63 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.31 
 
 
652 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
693 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32.14 
 
 
467 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5023  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.56 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.53 
 
 
652 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.12 
 
 
720 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.69 
 
 
638 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.36 
 
 
687 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.89 
 
 
423 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  23.94 
 
 
654 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  25.51 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0200  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.95 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0209  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.95 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.99 
 
 
654 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.91 
 
 
644 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.91 
 
 
644 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.74 
 
 
733 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>