82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2527 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2527  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  100 
 
 
394 aa  807    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  41.45 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3337  hypothetical protein  37.84 
 
 
342 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  38.63 
 
 
710 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  33.99 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  32.77 
 
 
324 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0917  putative aminopeptidase protein  33.62 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0248171  normal  0.161085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.71 
 
 
694 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.31 
 
 
668 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
668 aa  56.6  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.29 
 
 
674 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.29 
 
 
674 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.29 
 
 
674 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.66 
 
 
910 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.56 
 
 
688 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.36 
 
 
695 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  24.06 
 
 
688 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.87 
 
 
666 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  34.07 
 
 
729 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.82 
 
 
741 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  30.83 
 
 
735 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.08 
 
 
652 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.87 
 
 
766 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.39 
 
 
704 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.08 
 
 
664 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25 
 
 
693 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.06 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  22.12 
 
 
721 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  29.63 
 
 
719 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  30.14 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  36.36 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  27.54 
 
 
648 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  25.54 
 
 
691 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  30.37 
 
 
763 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.71 
 
 
765 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  30.33 
 
 
337 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.1 
 
 
750 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  22.42 
 
 
675 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.12 
 
 
709 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  28.47 
 
 
752 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  29.17 
 
 
317 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 
689 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.36 
 
 
660 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.94 
 
 
768 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30.2 
 
 
720 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.75 
 
 
680 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  27.82 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.68 
 
 
717 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.9 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.43 
 
 
608 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  29.23 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  29.23 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
687 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  29.63 
 
 
741 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.59 
 
 
692 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.37 
 
 
760 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.44 
 
 
678 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.87 
 
 
666 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.23 
 
 
681 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.87 
 
 
666 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.17 
 
 
681 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.29 
 
 
733 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.61 
 
 
575 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.75 
 
 
681 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  27.83 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.36 
 
 
675 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  29.23 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.6 
 
 
748 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.41 
 
 
677 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  22.12 
 
 
697 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 
667 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.9 
 
 
709 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  29.85 
 
 
763 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  29.85 
 
 
763 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  29.85 
 
 
763 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.23 
 
 
681 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  29.23 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  47.62 
 
 
253 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  33.02 
 
 
705 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.37 
 
 
721 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.44 
 
 
264 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24 
 
 
690 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>