33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1095 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  527  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2606  hypothetical protein  29.95 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  32.59 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7212  hypothetical protein  23.14 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  30.82 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  35.19 
 
 		 320 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  35.19 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 356 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.51 
 
 		 526 aa  45.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.81 
 
 		 568 aa  45.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  30.83 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.91 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  29.77 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  27.13 
 
 		 365 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.6 
 
 		 760 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  29.29 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  23.9 
 
 		 763 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  29.06 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  26.43 
 
 		 394 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  31.37 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  23.9 
 
 		 763 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2527  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  47.62 
 
 		 394 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367082  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  23.9 
 
 		 763 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  25.93 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0917  putative aminopeptidase protein  33.7 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0248171  normal  0.161085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  30.3 
 
 		 326 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 275 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  26.99 
 
 		 272 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>