172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0112 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  100 
 
 		 309 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  70.24 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  61.57 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  58.43 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  57.2 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  46.36 
 
 		 429 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  48.85 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  47.69 
 
 		 425 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  45.76 
 
 		 418 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  45.76 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  46.15 
 
 		 423 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  46.15 
 
 		 423 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  45.77 
 
 		 423 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  45.77 
 
 		 423 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  45.05 
 
 		 423 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  43.56 
 
 		 423 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  42.42 
 
 		 432 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  42.11 
 
 		 442 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  42.11 
 
 		 442 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  42.11 
 
 		 442 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  42.11 
 
 		 442 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  42.42 
 
 		 441 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  39.22 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  35.18 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  35.83 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  33.93 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  30.23 
 
 		 390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  29.96 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.02 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.13 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 		 611 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.36 
 
 		 628 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.97 
 
 		 612 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  28.86 
 
 		 652 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  33.12 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.24 
 
 		 651 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 		 594 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  28.19 
 
 		 655 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  28.19 
 
 		 654 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  28.19 
 
 		 654 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.5 
 
 		 669 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.39 
 
 		 653 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.41 
 
 		 628 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.81 
 
 		 653 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  28.57 
 
 		 652 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  30.47 
 
 		 655 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 		 654 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  30.47 
 
 		 655 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  27.52 
 
 		 655 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  30.06 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  29.69 
 
 		 654 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.91 
 
 		 631 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.5 
 
 		 634 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  29.3 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  24.19 
 
 		 674 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.43 
 
 		 695 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.87 
 
 		 652 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  33.12 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  30 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  47.27 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.61 
 
 		 604 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  31.62 
 
 		 675 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 		 681 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.71 
 
 		 635 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 		 681 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  30.22 
 
 		 688 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  35.65 
 
 		 720 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.16 
 
 		 675 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 		 675 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.69 
 
 		 678 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.82 
 
 		 683 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 		 690 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.4 
 
 		 680 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.67 
 
 		 944 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  24.9 
 
 		 665 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.48 
 
 		 621 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32.8 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.03 
 
 		 645 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.11 
 
 		 662 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.05 
 
 		 638 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  30.91 
 
 		 678 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 		 681 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 		 683 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.44 
 
 		 648 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  27.34 
 
 		 968 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  31.13 
 
 		 632 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.17 
 
 		 678 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 		 675 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.89 
 
 		 626 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  28.75 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  28.48 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2527  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.82 
 
 		 394 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 		 653 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  28.75 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.05 
 
 		 910 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  28.3 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>