158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0127 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  100 
 
 		 311 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  94.55 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  76.41 
 
 		 308 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  63.89 
 
 		 298 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  56.67 
 
 		 309 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  52.26 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  52.63 
 
 		 429 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  51.97 
 
 		 429 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  49.06 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  48.3 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  47.92 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  47.92 
 
 		 419 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  48.3 
 
 		 423 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  48.3 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  47.81 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  48.3 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  47.81 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  47.81 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  47.81 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  47.46 
 
 		 423 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  47.46 
 
 		 423 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  47.1 
 
 		 423 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  43.82 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  35.49 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  35.25 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  31.93 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  30.24 
 
 		 351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  30.52 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  27.8 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  30.86 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  30.24 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  24.73 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  29.38 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.09 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  35.19 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 		 695 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.33 
 
 		 721 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  26.16 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  30.66 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.21 
 
 		 716 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.89 
 
 		 656 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.49 
 
 		 669 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 		 642 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 		 653 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  26.5 
 
 		 497 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.85 
 
 		 638 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.09 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.86 
 
 		 634 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.08 
 
 		 596 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  30.17 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.65 
 
 		 628 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  32.76 
 
 		 665 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 587 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  31.94 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  30.87 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  30.81 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.32 
 
 		 644 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.62 
 
 		 580 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  30.34 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.66 
 
 		 668 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 		 685 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.48 
 
 		 755 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  37.61 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 		 688 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.2 
 
 		 660 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  28.07 
 
 		 638 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.05 
 
 		 646 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.24 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.21 
 
 		 651 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  33.63 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.23 
 
 		 668 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 		 697 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.83 
 
 		 708 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.09 
 
 		 686 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.5 
 
 		 840 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  29.63 
 
 		 876 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 		 692 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.67 
 
 		 604 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30.97 
 
 		 710 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.17 
 
 		 690 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.33 
 
 		 675 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 		 706 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.11 
 
 		 650 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 		 692 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 		 645 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.56 
 
 		 568 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.3 
 
 		 631 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  28.38 
 
 		 723 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1310  hypothetical protein  25.42 
 
 		 801 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  29.14 
 
 		 634 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.93 
 
 		 653 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  27.97 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.05 
 
 		 666 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.87 
 
 		 676 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.26 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.17 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.01 
 
 		 849 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>