More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0490 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  77.04 
 
 
675 aa  1113    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.27 
 
 
681 aa  1141    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  74.52 
 
 
673 aa  1087    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.22 
 
 
675 aa  1122    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.78 
 
 
698 aa  1062    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.56 
 
 
680 aa  1162    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.67 
 
 
673 aa  1086    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
675 aa  1398    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.33 
 
 
681 aa  1110    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.48 
 
 
681 aa  1113    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.67 
 
 
690 aa  1139    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.22 
 
 
698 aa  1083    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.33 
 
 
681 aa  1112    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  69.33 
 
 
688 aa  1028    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.16 
 
 
668 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.99 
 
 
709 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.71 
 
 
685 aa  347  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.88 
 
 
683 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
684 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.33 
 
 
687 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  32.17 
 
 
687 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.33 
 
 
687 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.33 
 
 
687 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.42 
 
 
683 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  31.64 
 
 
684 aa  339  9e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.22 
 
 
683 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.22 
 
 
682 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.22 
 
 
683 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.22 
 
 
683 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.34 
 
 
686 aa  334  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.52 
 
 
687 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.11 
 
 
684 aa  327  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  31.45 
 
 
717 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  30.97 
 
 
695 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.37 
 
 
720 aa  320  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  30.75 
 
 
674 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.41 
 
 
674 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.16 
 
 
700 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.52 
 
 
688 aa  309  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.88 
 
 
688 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.54 
 
 
680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.96 
 
 
674 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  31.34 
 
 
713 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  29.03 
 
 
648 aa  290  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 
687 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 
692 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.11 
 
 
675 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.38 
 
 
668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  29.9 
 
 
722 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.82 
 
 
698 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.18 
 
 
672 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.19 
 
 
686 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
673 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.55 
 
 
633 aa  234  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.8 
 
 
633 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.12 
 
 
670 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.08 
 
 
695 aa  219  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
661 aa  218  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  27.01 
 
 
704 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.35 
 
 
677 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.29 
 
 
708 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.67 
 
 
660 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  27.86 
 
 
698 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.92 
 
 
666 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.23 
 
 
667 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.95 
 
 
668 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.09 
 
 
701 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
694 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  29.48 
 
 
750 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.49 
 
 
688 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.92 
 
 
666 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.92 
 
 
666 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.3 
 
 
692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.57 
 
 
726 aa  201  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.86 
 
 
678 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.88 
 
 
697 aa  200  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.96 
 
 
697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
695 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.57 
 
 
720 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  26.36 
 
 
685 aa  197  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.03 
 
 
692 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.37 
 
 
704 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.42 
 
 
656 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.42 
 
 
656 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.58 
 
 
667 aa  184  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  28.95 
 
 
729 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.96 
 
 
682 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.99 
 
 
716 aa  180  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.61 
 
 
680 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.23 
 
 
729 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.81 
 
 
717 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.26 
 
 
655 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.37 
 
 
664 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.72 
 
 
762 aa  173  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.43 
 
 
709 aa  173  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.21 
 
 
617 aa  170  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.21 
 
 
652 aa  168  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.35 
 
 
735 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  23.91 
 
 
655 aa  163  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.15 
 
 
652 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>