More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2228 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  50 
 
 
695 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  79.37 
 
 
687 aa  1145    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
684 aa  1420    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.49 
 
 
682 aa  1150    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.45 
 
 
687 aa  1163    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  83.75 
 
 
683 aa  1241    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  74.96 
 
 
683 aa  1119    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  79.22 
 
 
683 aa  1149    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.41 
 
 
687 aa  1140    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.37 
 
 
683 aa  1150    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.56 
 
 
687 aa  1140    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.37 
 
 
683 aa  1150    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.72 
 
 
686 aa  1139    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.77 
 
 
687 aa  1139    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  87.57 
 
 
684 aa  1277    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.41 
 
 
709 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  74.71 
 
 
684 aa  1102    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.19 
 
 
685 aa  1224    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.07 
 
 
720 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  45.58 
 
 
713 aa  623  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.13 
 
 
688 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.91 
 
 
692 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.93 
 
 
700 aa  618  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  46.3 
 
 
717 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.53 
 
 
680 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.88 
 
 
668 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.36 
 
 
698 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  36.73 
 
 
674 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.58 
 
 
674 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.13 
 
 
674 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.05 
 
 
688 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.37 
 
 
687 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  32.18 
 
 
648 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.32 
 
 
675 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.79 
 
 
680 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  30.96 
 
 
675 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.69 
 
 
675 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.25 
 
 
681 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
681 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
681 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.67 
 
 
675 aa  328  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  33.69 
 
 
750 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.73 
 
 
681 aa  320  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.38 
 
 
673 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.38 
 
 
698 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  30.21 
 
 
688 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.52 
 
 
673 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  32.85 
 
 
729 aa  313  5.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.06 
 
 
698 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.37 
 
 
690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.5 
 
 
633 aa  307  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  31.49 
 
 
722 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.41 
 
 
633 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.06 
 
 
695 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.29 
 
 
668 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.92 
 
 
672 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
668 aa  237  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.21 
 
 
697 aa  233  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
666 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.64 
 
 
700 aa  223  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.35 
 
 
688 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.39 
 
 
670 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.19 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.19 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.07 
 
 
678 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.98 
 
 
694 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.91 
 
 
661 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.88 
 
 
704 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.72 
 
 
673 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.4 
 
 
652 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.71 
 
 
667 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.01 
 
 
680 aa  193  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.54 
 
 
709 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.69 
 
 
721 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.24 
 
 
677 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.82 
 
 
708 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.88 
 
 
716 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.79 
 
 
717 aa  177  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.93 
 
 
660 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.52 
 
 
726 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.6 
 
 
692 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.18 
 
 
720 aa  171  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.38 
 
 
697 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.63 
 
 
735 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.58 
 
 
762 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24.56 
 
 
719 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.12 
 
 
686 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.53 
 
 
695 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.71 
 
 
701 aa  156  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.85 
 
 
766 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.82 
 
 
682 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.65 
 
 
661 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  25.54 
 
 
656 aa  150  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.59 
 
 
656 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.85 
 
 
656 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.68 
 
 
648 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  23.87 
 
 
712 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.25 
 
 
667 aa  143  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.53 
 
 
665 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  22.36 
 
 
685 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>