More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4490 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.27 
 
 
675 aa  1141    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  85.96 
 
 
690 aa  1257    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  73.27 
 
 
675 aa  1067    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.66 
 
 
698 aa  1021    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.93 
 
 
673 aa  1033    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.3 
 
 
675 aa  1070    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  71.37 
 
 
673 aa  1039    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.37 
 
 
698 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.72 
 
 
681 aa  1064    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.86 
 
 
681 aa  1065    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
681 aa  1414    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.86 
 
 
681 aa  1066    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  66.03 
 
 
688 aa  986    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.84 
 
 
680 aa  1144    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.94 
 
 
668 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.47 
 
 
709 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.98 
 
 
683 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.74 
 
 
683 aa  333  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.12 
 
 
684 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
685 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.96 
 
 
686 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  30.57 
 
 
687 aa  324  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.39 
 
 
687 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.53 
 
 
687 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  30.79 
 
 
684 aa  321  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 
683 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.3 
 
 
683 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.39 
 
 
687 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 
682 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 
683 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.29 
 
 
684 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.99 
 
 
687 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.57 
 
 
700 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.89 
 
 
720 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.58 
 
 
680 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.42 
 
 
674 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  29.79 
 
 
717 aa  299  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  30.32 
 
 
695 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.54 
 
 
674 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.97 
 
 
674 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  29.99 
 
 
713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.22 
 
 
688 aa  287  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.29 
 
 
688 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  28.85 
 
 
648 aa  280  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.39 
 
 
692 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.95 
 
 
675 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.2 
 
 
687 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.92 
 
 
672 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.6 
 
 
686 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.18 
 
 
668 aa  244  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  30.31 
 
 
722 aa  242  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.93 
 
 
633 aa  240  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.13 
 
 
633 aa  234  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.99 
 
 
673 aa  230  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.84 
 
 
698 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.4 
 
 
668 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 
661 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.73 
 
 
695 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.72 
 
 
694 aa  218  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
666 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.65 
 
 
708 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.36 
 
 
695 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.93 
 
 
677 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.53 
 
 
666 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
666 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  25.74 
 
 
704 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.15 
 
 
670 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.87 
 
 
667 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  30.04 
 
 
750 aa  203  9e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  27.79 
 
 
698 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.27 
 
 
678 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.09 
 
 
720 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.22 
 
 
692 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.59 
 
 
704 aa  197  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
726 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.71 
 
 
697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  25.86 
 
 
685 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 
688 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 
697 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.96 
 
 
660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.74 
 
 
692 aa  185  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  25.09 
 
 
729 aa  184  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.58 
 
 
712 aa  180  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  25.04 
 
 
656 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.9 
 
 
762 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.63 
 
 
709 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.64 
 
 
656 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.86 
 
 
717 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.57 
 
 
680 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
664 aa  171  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24.36 
 
 
721 aa  171  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  23.53 
 
 
652 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.96 
 
 
655 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.5 
 
 
716 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.57 
 
 
667 aa  167  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.72 
 
 
617 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.74 
 
 
682 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  23.58 
 
 
655 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.38 
 
 
652 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 
701 aa  160  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>