More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2155 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.79 
 
 
683 aa  1140    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  50.14 
 
 
695 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.67 
 
 
683 aa  1119    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  77.23 
 
 
687 aa  1122    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.88 
 
 
682 aa  1138    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  83.31 
 
 
683 aa  1224    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  75.18 
 
 
685 aa  1110    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.08 
 
 
687 aa  1123    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.08 
 
 
687 aa  1121    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
686 aa  1426    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.72 
 
 
684 aa  1122    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.08 
 
 
687 aa  1122    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.52 
 
 
687 aa  1148    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.79 
 
 
683 aa  1140    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  79.64 
 
 
683 aa  1138    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  73.68 
 
 
684 aa  1084    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  75.55 
 
 
684 aa  1126    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.17 
 
 
720 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  45.83 
 
 
713 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.01 
 
 
688 aa  628  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.64 
 
 
709 aa  628  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.4 
 
 
700 aa  623  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.83 
 
 
692 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  45.61 
 
 
717 aa  614  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.72 
 
 
680 aa  598  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  45.39 
 
 
668 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.6 
 
 
698 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  38.34 
 
 
674 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.8 
 
 
674 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.95 
 
 
674 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.05 
 
 
688 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.4 
 
 
687 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  31.46 
 
 
648 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.12 
 
 
675 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  31.33 
 
 
675 aa  346  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.16 
 
 
680 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.34 
 
 
681 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.34 
 
 
681 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.2 
 
 
681 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.34 
 
 
675 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  32.12 
 
 
688 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.34 
 
 
675 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.04 
 
 
698 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
673 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.89 
 
 
673 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.96 
 
 
681 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.18 
 
 
698 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  30.07 
 
 
750 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.29 
 
 
690 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.22 
 
 
633 aa  312  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  33.09 
 
 
722 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.5 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  32.85 
 
 
729 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.42 
 
 
695 aa  270  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.48 
 
 
668 aa  267  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
668 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.74 
 
 
697 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.73 
 
 
672 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.27 
 
 
666 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.9 
 
 
670 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 
694 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.98 
 
 
666 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
666 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.16 
 
 
700 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.32 
 
 
688 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.95 
 
 
652 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.99 
 
 
673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.79 
 
 
678 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
661 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.5 
 
 
716 aa  206  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.99 
 
 
667 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.08 
 
 
704 aa  205  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.9 
 
 
680 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.24 
 
 
677 aa  200  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 
709 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.48 
 
 
720 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.7 
 
 
721 aa  187  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.98 
 
 
717 aa  184  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.12 
 
 
708 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.33 
 
 
686 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.75 
 
 
697 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.24 
 
 
695 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.69 
 
 
726 aa  174  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.56 
 
 
660 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.36 
 
 
692 aa  170  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.96 
 
 
766 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.71 
 
 
762 aa  163  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  38.27 
 
 
719 aa  163  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.68 
 
 
692 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.41 
 
 
729 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.67 
 
 
712 aa  153  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.22 
 
 
631 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  24.36 
 
 
685 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.81 
 
 
682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  23.04 
 
 
704 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.25 
 
 
701 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.02 
 
 
666 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  23.39 
 
 
691 aa  143  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.93 
 
 
661 aa  143  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  23.76 
 
 
698 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>