177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2842 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  73.38 
 
 
432 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  88.71 
 
 
423 aa  747    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  76.46 
 
 
423 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  89.15 
 
 
423 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  99.05 
 
 
418 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  89.15 
 
 
423 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  88.92 
 
 
423 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  73.38 
 
 
442 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  73.38 
 
 
441 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  73.38 
 
 
442 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  73.38 
 
 
442 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  73.38 
 
 
442 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  100 
 
 
419 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  88.68 
 
 
423 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  61.75 
 
 
429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  61.12 
 
 
425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  60.39 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  51.39 
 
 
308 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  47.94 
 
 
312 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  47.04 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  48.02 
 
 
298 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  45.49 
 
 
309 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  47.52 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  34.92 
 
 
372 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  31.25 
 
 
351 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  33.21 
 
 
304 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  29.94 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  31.56 
 
 
346 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.25 
 
 
331 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  29.88 
 
 
292 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  32.21 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  29.1 
 
 
665 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  26.25 
 
 
275 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.96 
 
 
596 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  26.04 
 
 
645 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.2 
 
 
594 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  32.14 
 
 
253 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.19 
 
 
612 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.82 
 
 
611 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.53 
 
 
695 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.9 
 
 
660 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.71 
 
 
645 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.52 
 
 
645 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.14 
 
 
645 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.52 
 
 
645 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.68 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.81 
 
 
474 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 
628 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.11 
 
 
642 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 
652 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  31.44 
 
 
321 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.34 
 
 
716 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  32.46 
 
 
678 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5023  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.94 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.14 
 
 
645 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37 
 
 
678 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.76 
 
 
610 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  26.99 
 
 
638 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  35.62 
 
 
655 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  35.62 
 
 
654 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  30.69 
 
 
320 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.72 
 
 
634 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  35.62 
 
 
654 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.28 
 
 
656 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  35.62 
 
 
652 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  30.82 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.01 
 
 
615 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  34.25 
 
 
655 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  30.43 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  36.67 
 
 
321 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.97 
 
 
771 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.51 
 
 
638 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
654 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 
651 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  34.25 
 
 
655 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  34.25 
 
 
655 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  27.66 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  23.79 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  28.41 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.97 
 
 
766 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.21 
 
 
767 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.75 
 
 
692 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.97 
 
 
771 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.96 
 
 
907 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.23 
 
 
735 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  32.88 
 
 
654 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  27.24 
 
 
386 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  34.25 
 
 
652 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  26.62 
 
 
568 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
272 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  27.12 
 
 
763 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 
339 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 
607 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  28.66 
 
 
442 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.43 
 
 
631 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.21 
 
 
750 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  31.71 
 
 
612 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.02 
 
 
607 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  27.12 
 
 
763 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  27.46 
 
 
284 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>