168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0268 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  78.34 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  77.9 
 
 		 312 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  67.86 
 
 		 298 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  59.63 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  54.33 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  53.94 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  50 
 
 		 429 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  52.19 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  51.39 
 
 		 418 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  51.39 
 
 		 419 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  50.6 
 
 		 423 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  51.39 
 
 		 423 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  51.39 
 
 		 423 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  51 
 
 		 423 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  50 
 
 		 423 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  48.43 
 
 		 442 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  48.43 
 
 		 442 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  48.43 
 
 		 442 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  48.43 
 
 		 442 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  48.43 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  48.43 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  43.72 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  38.11 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  33.9 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  34.43 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  28.46 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  30.08 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  27.86 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  30.11 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  37.5 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  24.79 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  25.94 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.9 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.39 
 
 		 695 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1310  hypothetical protein  26.79 
 
 		 801 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.19 
 
 		 876 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.07 
 
 		 721 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.18 
 
 		 688 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  31.62 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 		 634 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.7 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.94 
 
 		 648 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.33 
 
 		 656 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.29 
 
 		 690 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  33.96 
 
 		 632 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  30.82 
 
 		 497 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.42 
 
 		 675 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 		 628 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30.41 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.91 
 
 		 669 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 		 365 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  31.62 
 
 		 665 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  27.73 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.27 
 
 		 660 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.2 
 
 		 652 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.08 
 
 		 596 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3062  glutamyl peptidase  27.4 
 
 		 802 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.310583  hitchhiker  0.000145911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.79 
 
 		 654 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  26.51 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  36.11 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2884  glutamyl peptidase  26.91 
 
 		 801 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.880612  decreased coverage  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.68 
 
 		 655 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.61 
 
 		 635 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2966  glutamyl peptidase  26.91 
 
 		 801 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.345209  hitchhiker  0.000634709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.54 
 
 		 604 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  33.33 
 
 		 675 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  29.73 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.35 
 
 		 631 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 		 675 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.61 
 
 		 968 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.09 
 
 		 645 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  31.09 
 
 		 634 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.15 
 
 		 681 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  26.79 
 
 		 655 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  26.14 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30.72 
 
 		 710 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  28.47 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.4 
 
 		 673 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.32 
 
 		 716 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.68 
 
 		 647 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  26.79 
 
 		 652 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.38 
 
 		 681 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.38 
 
 		 681 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.36 
 
 		 651 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  26.79 
 
 		 654 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.26 
 
 		 646 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  26.79 
 
 		 655 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.05 
 
 		 580 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  26.8 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.43 
 
 		 680 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  25.89 
 
 		 655 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  27.8 
 
 		 442 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.89 
 
 		 654 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  25.89 
 
 		 654 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.39 
 
 		 705 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.23 
 
 		 673 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 		 688 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>