More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3062 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1310  hypothetical protein  82.6 
 
 
801 aa  1361    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1099  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.29 
 
 
858 aa  794    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2884  glutamyl peptidase  87.86 
 
 
801 aa  1429    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.880612  decreased coverage  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2966  glutamyl peptidase  86.61 
 
 
801 aa  1407    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.345209  hitchhiker  0.000634709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.86 
 
 
840 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3062  glutamyl peptidase  100 
 
 
802 aa  1641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.310583  hitchhiker  0.000145911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  49.94 
 
 
849 aa  813    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0846  hypothetical protein  43.11 
 
 
841 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.826498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.75 
 
 
829 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.293087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.97 
 
 
840 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.52 
 
 
815 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_249  predicted protein  36.24 
 
 
835 aa  439  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0915  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.36 
 
 
920 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  35.1 
 
 
865 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.66 
 
 
833 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.43 
 
 
820 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05496  hypothetical protein  54.21 
 
 
181 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.21 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
688 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.69 
 
 
838 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.88 
 
 
692 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.47 
 
 
864 aa  80.9  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
692 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
686 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.67 
 
 
680 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.7 
 
 
631 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
708 aa  74.7  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.79 
 
 
689 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.12 
 
 
594 aa  73.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  28.19 
 
 
691 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.24 
 
 
691 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.97 
 
 
677 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.98 
 
 
605 aa  73.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.22 
 
 
634 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.2 
 
 
667 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.66 
 
 
607 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.99 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  27.61 
 
 
612 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 
607 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.81 
 
 
656 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.94 
 
 
697 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.21 
 
 
617 aa  68.2  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.5 
 
 
868 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0410  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
712 aa  67.8  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0851483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.85 
 
 
931 aa  67.4  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.91 
 
 
695 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.79 
 
 
735 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.64 
 
 
575 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.24 
 
 
982 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.69 
 
 
847 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.98 
 
 
619 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2548  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.96 
 
 
644 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152955  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.03 
 
 
642 aa  66.6  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.62 
 
 
653 aa  66.6  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.72 
 
 
680 aa  66.6  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25.08 
 
 
693 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
716 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.41 
 
 
655 aa  65.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.91 
 
 
942 aa  65.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 
644 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.88 
 
 
1001 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  26.91 
 
 
529 aa  65.1  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  28.86 
 
 
688 aa  65.1  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  25.34 
 
 
656 aa  64.7  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  29.41 
 
 
643 aa  64.7  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.91 
 
 
938 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 
643 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.91 
 
 
938 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.68 
 
 
674 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
661 aa  64.3  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
944 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.46 
 
 
944 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  25.34 
 
 
656 aa  64.3  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
944 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.68 
 
 
674 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
944 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.24 
 
 
588 aa  63.9  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30 
 
 
720 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.73 
 
 
665 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  22.77 
 
 
841 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.09 
 
 
673 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.73 
 
 
726 aa  63.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.17 
 
 
607 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.65 
 
 
760 aa  62.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
870 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4095  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.94 
 
 
620 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.48 
 
 
845 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.47 
 
 
870 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.32 
 
 
680 aa  62  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.25 
 
 
682 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.52 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
938 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.36 
 
 
824 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.52 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.52 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.3 
 
 
648 aa  61.6  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.75 
 
 
776 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.56 
 
 
667 aa  61.6  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.4 
 
 
822 aa  62  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.39 
 
 
957 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>