More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2979 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  74.76 
 
 
529 aa  868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  64.05 
 
 
944 aa  1276    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  50 
 
 
989 aa  966    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.63 
 
 
944 aa  1268    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.99 
 
 
941 aa  1255    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.7 
 
 
957 aa  1442    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.42 
 
 
938 aa  1292    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.21 
 
 
938 aa  1285    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  55.44 
 
 
955 aa  1108    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
931 aa  1920    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  64.05 
 
 
944 aa  1261    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.21 
 
 
938 aa  1288    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.52 
 
 
943 aa  1385    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  56.56 
 
 
942 aa  1046    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.63 
 
 
944 aa  1268    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.64 
 
 
937 aa  1299    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.44 
 
 
931 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.33 
 
 
918 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.11 
 
 
982 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 
1001 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.18 
 
 
868 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.78 
 
 
864 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.39 
 
 
847 aa  267  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.25 
 
 
870 aa  263  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 
838 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.89 
 
 
641 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.54 
 
 
880 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.76 
 
 
882 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.01 
 
 
861 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.72 
 
 
845 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.41 
 
 
870 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.08 
 
 
822 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  32.89 
 
 
691 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.85 
 
 
689 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  32.09 
 
 
693 aa  124  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 
822 aa  122  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 
648 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.67 
 
 
660 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.07 
 
 
824 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  29.52 
 
 
656 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.47 
 
 
692 aa  109  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.69 
 
 
631 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.59 
 
 
673 aa  107  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.78 
 
 
656 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.04 
 
 
575 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
686 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.69 
 
 
652 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.95 
 
 
910 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.82 
 
 
692 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.77 
 
 
678 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.69 
 
 
654 aa  102  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  26.26 
 
 
841 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.88 
 
 
688 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.08 
 
 
670 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.84 
 
 
680 aa  100  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.41 
 
 
682 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.24 
 
 
691 aa  99  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.41 
 
 
652 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  24.38 
 
 
654 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.18 
 
 
652 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 
924 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.34 
 
 
655 aa  94  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  24.09 
 
 
655 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  24.09 
 
 
654 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.35 
 
 
677 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.09 
 
 
654 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.24 
 
 
665 aa  92  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
686 aa  92  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
807 aa  91.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.34 
 
 
720 aa  91.3  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.09 
 
 
655 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.41 
 
 
720 aa  90.1  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.5 
 
 
630 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
813 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.17 
 
 
840 aa  89  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.41 
 
 
705 aa  88.2  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  23.36 
 
 
655 aa  88.2  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.62 
 
 
646 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.72 
 
 
678 aa  88.2  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  27.36 
 
 
685 aa  87.8  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.57 
 
 
672 aa  87  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1306  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.51 
 
 
651 aa  86.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.11 
 
 
626 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 
667 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.66 
 
 
716 aa  86.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 
626 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
683 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.69 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.73 
 
 
708 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.08 
 
 
588 aa  85.1  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
697 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.21 
 
 
820 aa  85.1  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  27.7 
 
 
865 aa  85.1  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.12 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.32 
 
 
615 aa  84.7  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.24 
 
 
680 aa  84.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.89 
 
 
683 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  27.83 
 
 
687 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.72 
 
 
638 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>