More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2790 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  96.41 
 
 
529 aa  1073    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  52.48 
 
 
989 aa  1008    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.72 
 
 
931 aa  1270    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  98.51 
 
 
938 aa  1905    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
938 aa  1932    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.64 
 
 
944 aa  1683    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  83.8 
 
 
941 aa  1657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  84.64 
 
 
944 aa  1682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.11 
 
 
955 aa  1121    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.06 
 
 
943 aa  1332    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.62 
 
 
937 aa  1273    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  98.08 
 
 
938 aa  1904    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.32 
 
 
944 aa  1655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  59.05 
 
 
942 aa  1101    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.44 
 
 
957 aa  1343    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.53 
 
 
944 aa  1680    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.04 
 
 
982 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.59 
 
 
918 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.08 
 
 
931 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.41 
 
 
1001 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.58 
 
 
868 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.82 
 
 
864 aa  289  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.79 
 
 
870 aa  270  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.54 
 
 
847 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.26 
 
 
641 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.63 
 
 
882 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.36 
 
 
838 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.16 
 
 
861 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.18 
 
 
880 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.11 
 
 
845 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.7 
 
 
822 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 
870 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  31.39 
 
 
691 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31 
 
 
689 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.52 
 
 
648 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.92 
 
 
822 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  30.43 
 
 
693 aa  114  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.5 
 
 
660 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.61 
 
 
631 aa  107  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.94 
 
 
813 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.14 
 
 
678 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
824 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
692 aa  102  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.65 
 
 
692 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.78 
 
 
656 aa  100  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.47 
 
 
682 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 
910 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.41 
 
 
656 aa  99  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.95 
 
 
686 aa  98.6  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24 
 
 
652 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.93 
 
 
688 aa  96.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.47 
 
 
691 aa  96.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.45 
 
 
654 aa  95.5  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.05 
 
 
680 aa  95.5  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.14 
 
 
807 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.09 
 
 
652 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.45 
 
 
652 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  23.67 
 
 
654 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.28 
 
 
630 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.43 
 
 
673 aa  92  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.5 
 
 
686 aa  91.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.77 
 
 
677 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  23.43 
 
 
841 aa  89  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.37 
 
 
678 aa  89  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  23.72 
 
 
654 aa  87.8  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.72 
 
 
654 aa  87.8  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
924 aa  87.8  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  23.72 
 
 
655 aa  87.8  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  20.92 
 
 
670 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.54 
 
 
655 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.56 
 
 
575 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.33 
 
 
840 aa  87  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.83 
 
 
648 aa  85.9  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.91 
 
 
594 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.69 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.86 
 
 
655 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  24.53 
 
 
685 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.68 
 
 
588 aa  83.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.9 
 
 
665 aa  84.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  27.9 
 
 
865 aa  83.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.47 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  22.03 
 
 
704 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.09 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.59 
 
 
672 aa  82.8  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.04 
 
 
820 aa  82.4  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  22.99 
 
 
655 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.94 
 
 
674 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.64 
 
 
833 aa  81.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
697 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.49 
 
 
716 aa  81.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  25.94 
 
 
657 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.1 
 
 
678 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.18 
 
 
596 aa  80.5  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.81 
 
 
666 aa  80.5  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.95 
 
 
720 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.49 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.65 
 
 
626 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
626 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
667 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.94 
 
 
762 aa  79.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>