More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1539 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1092    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.76 
 
 
931 aa  867    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  65.14 
 
 
989 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.36 
 
 
944 aa  1019    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  96.41 
 
 
938 aa  1070    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  96.41 
 
 
938 aa  1071    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.81 
 
 
937 aa  839    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.27 
 
 
955 aa  809    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  90.55 
 
 
944 aa  1021    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  95.27 
 
 
938 aa  1061    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.27 
 
 
957 aa  901    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  65.78 
 
 
942 aa  743    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  88.57 
 
 
941 aa  1003    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.36 
 
 
944 aa  1019    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.36 
 
 
944 aa  1017    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  75.19 
 
 
943 aa  883    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.98 
 
 
918 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.24 
 
 
982 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.62 
 
 
931 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.3 
 
 
1001 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.09 
 
 
868 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.52 
 
 
864 aa  296  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.81 
 
 
870 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.6 
 
 
847 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.49 
 
 
838 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.97 
 
 
641 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.78 
 
 
880 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.28 
 
 
882 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.48 
 
 
861 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.74 
 
 
845 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.13 
 
 
822 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 
870 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  31.39 
 
 
691 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31 
 
 
689 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.72 
 
 
648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
822 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  30.43 
 
 
693 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.74 
 
 
660 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.61 
 
 
631 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.46 
 
 
813 aa  107  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.14 
 
 
678 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.22 
 
 
692 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.78 
 
 
656 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.51 
 
 
692 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.53 
 
 
910 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.41 
 
 
656 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.31 
 
 
682 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.26 
 
 
691 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.84 
 
 
824 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.73 
 
 
686 aa  97.4  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.5 
 
 
652 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.12 
 
 
680 aa  96.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
688 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
807 aa  93.6  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.09 
 
 
654 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.72 
 
 
652 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.77 
 
 
677 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.14 
 
 
686 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  23.32 
 
 
654 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.09 
 
 
652 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.29 
 
 
673 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.57 
 
 
630 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.64 
 
 
678 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.79 
 
 
575 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  23.08 
 
 
841 aa  85.5  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.78 
 
 
670 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  23.36 
 
 
655 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  23.36 
 
 
654 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.55 
 
 
594 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.36 
 
 
654 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.73 
 
 
596 aa  84.7  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.81 
 
 
648 aa  84.7  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  28.06 
 
 
865 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.73 
 
 
615 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.11 
 
 
655 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.36 
 
 
820 aa  83.6  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  26.17 
 
 
657 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
833 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.59 
 
 
655 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.58 
 
 
840 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.37 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.46 
 
 
588 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.59 
 
 
672 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.71 
 
 
665 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  24.06 
 
 
685 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.82 
 
 
621 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.09 
 
 
924 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.09 
 
 
708 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.41 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.79 
 
 
667 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.37 
 
 
666 aa  80.5  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  22.63 
 
 
655 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  26.01 
 
 
678 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.99 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  25.9 
 
 
656 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.93 
 
 
729 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
626 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.57 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.98 
 
 
626 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>