More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2337 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.3 
 
 
931 aa  965    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
918 aa  1900    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.34 
 
 
1001 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 
982 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.28 
 
 
938 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.67 
 
 
937 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.9 
 
 
943 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.96 
 
 
938 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.56 
 
 
938 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.91 
 
 
944 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.19 
 
 
944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.43 
 
 
944 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.39 
 
 
944 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.11 
 
 
931 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.83 
 
 
957 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.29 
 
 
941 aa  436  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.04 
 
 
942 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.22 
 
 
955 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.2 
 
 
989 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.52 
 
 
861 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.22 
 
 
868 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  38.98 
 
 
529 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.73 
 
 
882 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.85 
 
 
864 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.46 
 
 
838 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.08 
 
 
641 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.81 
 
 
880 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.59 
 
 
847 aa  275  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.61 
 
 
822 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.04 
 
 
870 aa  258  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.36 
 
 
845 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.31 
 
 
870 aa  234  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.51 
 
 
822 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.47 
 
 
824 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.16 
 
 
652 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  24.92 
 
 
841 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.35 
 
 
660 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.82 
 
 
652 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  26.91 
 
 
652 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.85 
 
 
648 aa  98.2  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.09 
 
 
654 aa  98.2  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.45 
 
 
655 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
813 aa  97.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 
686 aa  97.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.74 
 
 
654 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  25.74 
 
 
655 aa  95.9  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  25.74 
 
 
654 aa  95.9  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  24.73 
 
 
654 aa  94  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
692 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  25.45 
 
 
655 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1251  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.56 
 
 
638 aa  93.6  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.09 
 
 
655 aa  90.9  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.67 
 
 
692 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 
680 aa  88.2  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 
682 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.67 
 
 
688 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
840 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.77 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.84 
 
 
677 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.92 
 
 
633 aa  84  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.68 
 
 
673 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.99 
 
 
910 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  25.72 
 
 
688 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.09 
 
 
670 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
689 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.64 
 
 
681 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.05 
 
 
680 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.77 
 
 
691 aa  79  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
849 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.42 
 
 
631 aa  77.8  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.91 
 
 
673 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
690 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.67 
 
 
807 aa  77  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.69 
 
 
686 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
673 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  25.75 
 
 
691 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  26.26 
 
 
675 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
698 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  23.73 
 
 
648 aa  75.5  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.76 
 
 
675 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.89 
 
 
709 aa  75.1  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.57 
 
 
698 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.13 
 
 
762 aa  73.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.18 
 
 
656 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.46 
 
 
615 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.29 
 
 
655 aa  73.2  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
675 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.74 
 
 
667 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.94 
 
 
688 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 
719 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  25.26 
 
 
657 aa  72  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.48 
 
 
672 aa  72  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.1 
 
 
697 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25.81 
 
 
693 aa  70.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.93 
 
 
686 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.44 
 
 
708 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.88 
 
 
665 aa  70.1  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>