More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2778 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  70.27 
 
 
529 aa  810    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  55.91 
 
 
937 aa  1110    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  54.01 
 
 
989 aa  1037    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.64 
 
 
944 aa  1136    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.39 
 
 
938 aa  1118    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.11 
 
 
938 aa  1119    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  55.75 
 
 
957 aa  1126    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.32 
 
 
931 aa  1101    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.28 
 
 
943 aa  1132    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
955 aa  1980    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.31 
 
 
938 aa  1123    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.99 
 
 
944 aa  1123    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  51.66 
 
 
942 aa  991    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  56.55 
 
 
944 aa  1130    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  54.63 
 
 
941 aa  1094    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.64 
 
 
944 aa  1133    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31 
 
 
1001 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.27 
 
 
982 aa  459  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.55 
 
 
931 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.22 
 
 
918 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.7 
 
 
868 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 
864 aa  299  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.56 
 
 
847 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
870 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.1 
 
 
641 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.04 
 
 
880 aa  237  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.77 
 
 
845 aa  234  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.52 
 
 
882 aa  234  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
838 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.2 
 
 
861 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.08 
 
 
870 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.81 
 
 
822 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.04 
 
 
689 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.12 
 
 
822 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  27.95 
 
 
691 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.96 
 
 
660 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  29.6 
 
 
693 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.91 
 
 
654 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.64 
 
 
652 aa  108  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.14 
 
 
824 aa  108  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.81 
 
 
631 aa  107  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 
910 aa  106  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.26 
 
 
686 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  26.33 
 
 
654 aa  104  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.04 
 
 
656 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.01 
 
 
648 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.27 
 
 
652 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  26.24 
 
 
655 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  26.24 
 
 
654 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.24 
 
 
654 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
682 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  27.68 
 
 
656 aa  102  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.64 
 
 
673 aa  102  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.53 
 
 
680 aa  101  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.76 
 
 
686 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.16 
 
 
655 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.4 
 
 
692 aa  100  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.74 
 
 
575 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.03 
 
 
652 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.73 
 
 
655 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.16 
 
 
692 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  24.6 
 
 
841 aa  95.9  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.46 
 
 
807 aa  95.1  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.36 
 
 
655 aa  94.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.63 
 
 
670 aa  94.7  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.88 
 
 
672 aa  94.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.21 
 
 
924 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  29.08 
 
 
648 aa  92  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.16 
 
 
688 aa  91.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.36 
 
 
630 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.69 
 
 
594 aa  91.3  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
813 aa  91.3  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.94 
 
 
691 aa  89  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  28.25 
 
 
685 aa  89  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24 
 
 
678 aa  88.6  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.42 
 
 
656 aa  88.2  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.75 
 
 
820 aa  88.2  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.65 
 
 
642 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.68 
 
 
680 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.8 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13777  predicted protein  29.77 
 
 
206 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.15 
 
 
667 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.79 
 
 
677 aa  84.7  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0410  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.03 
 
 
712 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0851483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.55 
 
 
833 aa  82.4  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.02 
 
 
840 aa  82  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.05 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.47 
 
 
622 aa  82.4  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.66 
 
 
665 aa  82  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.02 
 
 
720 aa  81.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.76 
 
 
705 aa  81.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.01 
 
 
762 aa  81.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.16 
 
 
697 aa  81.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  24.63 
 
 
656 aa  80.9  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  27.11 
 
 
865 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.94 
 
 
615 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.72 
 
 
682 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.67 
 
 
720 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>