More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1099 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1099  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
858 aa  1775    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1310  hypothetical protein  47.27 
 
 
801 aa  777    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2884  glutamyl peptidase  47.41 
 
 
801 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.880612  decreased coverage  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2966  glutamyl peptidase  47.23 
 
 
801 aa  782    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.345209  hitchhiker  0.000634709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.7 
 
 
849 aa  1132    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3062  glutamyl peptidase  47.41 
 
 
802 aa  799    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.310583  hitchhiker  0.000145911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.16 
 
 
840 aa  1122    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0846  hypothetical protein  39.77 
 
 
841 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.826498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.47 
 
 
840 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.16 
 
 
829 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.293087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
815 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0915  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.37 
 
 
920 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24232  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_249  predicted protein  34.85 
 
 
835 aa  446  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  33.29 
 
 
865 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.6 
 
 
833 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.81 
 
 
820 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05496  hypothetical protein  58.33 
 
 
181 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.53 
 
 
692 aa  95.1  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.87 
 
 
692 aa  93.2  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
688 aa  92.8  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.87 
 
 
686 aa  88.6  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  25.08 
 
 
688 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.52 
 
 
660 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.07 
 
 
838 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.71 
 
 
942 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.41 
 
 
680 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.18 
 
 
691 aa  82  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.36 
 
 
716 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.42 
 
 
594 aa  81.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24 
 
 
868 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.05 
 
 
864 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
944 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
944 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.87 
 
 
944 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.03 
 
 
1001 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.75 
 
 
677 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
944 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.72 
 
 
653 aa  78.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.26 
 
 
938 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.04 
 
 
931 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.55 
 
 
726 aa  77.8  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
938 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.91 
 
 
938 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.74 
 
 
634 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.79 
 
 
689 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.13 
 
 
652 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
654 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.14 
 
 
656 aa  75.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.87 
 
 
822 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.83 
 
 
655 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  24.3 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.14 
 
 
656 aa  75.5  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.76 
 
 
667 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.57 
 
 
957 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.49 
 
 
943 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.78 
 
 
655 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.93 
 
 
692 aa  73.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.83 
 
 
931 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.04 
 
 
762 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.83 
 
 
654 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  26.83 
 
 
655 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  26.83 
 
 
654 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.05 
 
 
982 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.52 
 
 
824 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  27.05 
 
 
691 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.41 
 
 
882 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  24.24 
 
 
649 aa  72  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.01 
 
 
937 aa  72  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.45 
 
 
631 aa  71.6  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.73 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 
646 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  26.42 
 
 
841 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.78 
 
 
652 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.53 
 
 
690 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.72 
 
 
652 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.56 
 
 
955 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.4 
 
 
617 aa  70.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.72 
 
 
652 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.2 
 
 
656 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.72 
 
 
652 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.77 
 
 
612 aa  69.7  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.51 
 
 
941 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.64 
 
 
708 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.78 
 
 
697 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  22.68 
 
 
867 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.88 
 
 
619 aa  68.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.12 
 
 
845 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.95 
 
 
675 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.55 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  27 
 
 
654 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.71 
 
 
641 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.54 
 
 
611 aa  68.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.35 
 
 
680 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.03 
 
 
630 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.97 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.97 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.42 
 
 
596 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.09 
 
 
918 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.08 
 
 
638 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  20.97 
 
 
681 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>