More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1208 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1310  hypothetical protein  49.63 
 
 
801 aa  799    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
849 aa  1748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  69.49 
 
 
840 aa  1194    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2884  glutamyl peptidase  49.63 
 
 
801 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.880612  decreased coverage  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2966  glutamyl peptidase  49.02 
 
 
801 aa  793    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.345209  hitchhiker  0.000634709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1099  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.58 
 
 
858 aa  1129    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3062  glutamyl peptidase  49.94 
 
 
802 aa  813    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.310583  hitchhiker  0.000145911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0846  hypothetical protein  41.09 
 
 
841 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.826498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.81 
 
 
829 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.293087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.96 
 
 
840 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.78 
 
 
815 aa  466  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_249  predicted protein  35.06 
 
 
835 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0915  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.49 
 
 
920 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  32.51 
 
 
865 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.24 
 
 
833 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.45 
 
 
820 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05496  hypothetical protein  55.56 
 
 
181 aa  119  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 
688 aa  95.9  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.8 
 
 
692 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  29.51 
 
 
688 aa  89.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.38 
 
 
868 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.66 
 
 
692 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.78 
 
 
686 aa  88.6  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.71 
 
 
838 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.82 
 
 
660 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.05 
 
 
864 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.92 
 
 
691 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.17 
 
 
680 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
677 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.21 
 
 
656 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  26.35 
 
 
691 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.08 
 
 
918 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.61 
 
 
931 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.25 
 
 
944 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
938 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.39 
 
 
882 aa  77.8  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.49 
 
 
1001 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
938 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.17 
 
 
931 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.47 
 
 
656 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.47 
 
 
982 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.48 
 
 
938 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.47 
 
 
656 aa  76.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  24.45 
 
 
649 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.82 
 
 
944 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.54 
 
 
944 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.82 
 
 
944 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.15 
 
 
955 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.73 
 
 
845 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.36 
 
 
689 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.08 
 
 
870 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  27 
 
 
529 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.27 
 
 
943 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27 
 
 
957 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.86 
 
 
726 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.34 
 
 
716 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.92 
 
 
822 aa  72  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.76 
 
 
673 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.05 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.92 
 
 
667 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.51 
 
 
653 aa  71.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.77 
 
 
942 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.44 
 
 
698 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.55 
 
 
708 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.29 
 
 
690 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.26 
 
 
680 aa  70.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.83 
 
 
631 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.08 
 
 
673 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.41 
 
 
634 aa  70.1  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.02 
 
 
697 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
937 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.92 
 
 
847 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.45 
 
 
643 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  24.81 
 
 
841 aa  68.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  24.37 
 
 
675 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.44 
 
 
681 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.44 
 
 
681 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.86 
 
 
941 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.44 
 
 
681 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
675 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.43 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.8 
 
 
652 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.61 
 
 
654 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  22.94 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
822 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.81 
 
 
907 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.09 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.37 
 
 
698 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.44 
 
 
652 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.33 
 
 
687 aa  67.8  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.44 
 
 
652 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.44 
 
 
652 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.4 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  24.92 
 
 
693 aa  67.4  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  23.32 
 
 
655 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2548  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.08 
 
 
644 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152955  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.92 
 
 
695 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.56 
 
 
575 aa  67  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.22 
 
 
630 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>