152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2930 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  71.17 
 
 
432 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  93.41 
 
 
423 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  75 
 
 
423 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  100 
 
 
423 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  87.5 
 
 
418 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  100 
 
 
423 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  71.17 
 
 
442 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  71.17 
 
 
441 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  71.17 
 
 
442 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  71.17 
 
 
442 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  71.17 
 
 
442 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  91.27 
 
 
423 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  98.58 
 
 
423 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  87.74 
 
 
419 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  60.66 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  60.88 
 
 
429 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  60.56 
 
 
429 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  51.39 
 
 
308 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  49.06 
 
 
312 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  48.68 
 
 
311 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  47.62 
 
 
298 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  46.15 
 
 
309 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  35.45 
 
 
372 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  46.69 
 
 
279 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  30.81 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  33.08 
 
 
304 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  29.52 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  32.04 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  32.03 
 
 
331 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  31.47 
 
 
292 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  35.57 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.96 
 
 
596 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  32.14 
 
 
253 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  32.41 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  29.25 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.41 
 
 
651 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  24.26 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.68 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.33 
 
 
580 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  25.74 
 
 
645 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.82 
 
 
611 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  23.53 
 
 
337 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.58 
 
 
695 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  31.34 
 
 
665 aa  53.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.69 
 
 
653 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 
628 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.51 
 
 
612 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  23.67 
 
 
339 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.37 
 
 
653 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  23.08 
 
 
337 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  25.53 
 
 
342 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  25.53 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.37 
 
 
642 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  23.67 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  23.08 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  30.27 
 
 
320 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.78 
 
 
645 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  31.67 
 
 
474 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  25.54 
 
 
275 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.66 
 
 
716 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  35.29 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.95 
 
 
631 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  31.44 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.88 
 
 
645 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  31.15 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.45 
 
 
594 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.75 
 
 
645 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.75 
 
 
645 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  31.86 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.64 
 
 
678 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  29.68 
 
 
608 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  34.78 
 
 
678 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.37 
 
 
688 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.12 
 
 
625 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  31.13 
 
 
306 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.85 
 
 
645 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  30.2 
 
 
309 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.94 
 
 
677 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.6 
 
 
677 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.87 
 
 
652 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.81 
 
 
367 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.81 
 
 
367 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.84 
 
 
719 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.43 
 
 
382 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.43 
 
 
382 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  30.43 
 
 
382 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  30.43 
 
 
382 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.81 
 
 
364 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  28.8 
 
 
729 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  29.06 
 
 
328 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 
356 aa  46.6  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  27.46 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.22 
 
 
692 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.43 
 
 
708 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.5 
 
 
692 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  36.62 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  26.71 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.3 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.36 
 
 
677 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>