87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0072 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  100 
 
 
365 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  72.6 
 
 
356 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  52.08 
 
 
320 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  51.04 
 
 
321 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  49.28 
 
 
325 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  34.72 
 
 
283 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  35.95 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  37.07 
 
 
275 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  34.16 
 
 
275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  34.24 
 
 
328 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  35.42 
 
 
275 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  30.89 
 
 
272 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  31.97 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  33.94 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  29.65 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  32.53 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  25.38 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  33.01 
 
 
729 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  28.32 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.81 
 
 
741 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  27.97 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  27.17 
 
 
335 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  30.9 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  31.71 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  25.53 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  29.83 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  32.52 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.72 
 
 
751 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  27.07 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  28.82 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  26.77 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  29.21 
 
 
270 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  31.94 
 
 
311 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  29.41 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.3 
 
 
253 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1173  dienelactone hydrolase  31.07 
 
 
197 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  27.87 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  37.65 
 
 
646 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  28.25 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  29.86 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  27.32 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  27.32 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.65 
 
 
641 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.7 
 
 
295 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 
291 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 
291 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 
291 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 
291 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  27.55 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  29.55 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  25.27 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  25.27 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  25.27 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3037  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain-containing protein  32.74 
 
 
685 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  25.27 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  27.55 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  25.27 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  25.28 
 
 
236 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  27.55 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.86 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  27.13 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.103267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  24.73 
 
 
271 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  25.27 
 
 
269 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  24.73 
 
 
271 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.63 
 
 
628 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  28.42 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  26.23 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.9 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  25.82 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
296 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  31.91 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  27.04 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  27.87 
 
 
275 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
755 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.04 
 
 
419 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.04 
 
 
418 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.11 
 
 
642 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  26.95 
 
 
261 aa  43.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  26.74 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  34.69 
 
 
711 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  24.73 
 
 
270 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  34.58 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 
292 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>