38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0643 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 292 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  33.07 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.81 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30.96 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  28.24 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  26.25 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  26.73 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  25.11 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.96 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  26.76 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  27.5 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  29.01 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  27.78 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  25.55 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.29 
 
 		 669 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  25.4 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  22.13 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  27.55 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  31.91 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  29.91 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  24.47 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  34.95 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  24.05 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.05 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  35.51 
 
 		 477 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.61 
 
 		 767 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.61 
 
 		 766 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.61 
 
 		 771 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 		 365 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>