41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2757 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  32.85 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  32.85 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  37.74 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  35.62 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  29.22 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  34.44 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30.26 
 
 		 284 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  33.12 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.97 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  30.66 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  27.48 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  29.73 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  28.87 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  33.64 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  34.71 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  38.04 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  38.04 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  38.04 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  34.55 
 
 		 467 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  27.38 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  33.85 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  32.81 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 		 290 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  31.09 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  27.38 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  30.77 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.03 
 
 		 634 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  34.86 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  26.79 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  35.85 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  24.31 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.68 
 
 		 626 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.9 
 
 		 664 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  25.49 
 
 		 275 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.65 
 
 		 642 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>