93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5814 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  423  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  73.74 
 
 
349 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  73.74 
 
 
349 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  45.83 
 
 
334 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  37.97 
 
 
326 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  41.77 
 
 
351 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  33.58 
 
 
335 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  34.72 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  34.33 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  32.76 
 
 
298 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.15 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  27.66 
 
 
299 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  39.64 
 
 
284 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32.12 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  32.79 
 
 
263 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 
281 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  30.19 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  37.04 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  28.46 
 
 
299 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  34.04 
 
 
283 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  29.2 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.89 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  30.33 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  32.74 
 
 
281 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
269 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  31.91 
 
 
283 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
241 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  32.5 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  29.08 
 
 
321 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  27.05 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  26.23 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  31.68 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.68 
 
 
263 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.41 
 
 
298 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.96 
 
 
298 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5622  Acetyl xylan esterase  28.18 
 
 
407 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.951758  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  26.34 
 
 
356 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.89 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  30.65 
 
 
309 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  30.69 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  30.58 
 
 
301 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  30.99 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
254 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 
259 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 
264 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  28.1 
 
 
362 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.04 
 
 
292 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  28.12 
 
 
735 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  28.91 
 
 
299 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.69 
 
 
309 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  26.72 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  26.4 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  30.84 
 
 
467 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  34.95 
 
 
292 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  30.25 
 
 
304 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  25.86 
 
 
262 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  30.84 
 
 
324 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.17 
 
 
317 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  26.83 
 
 
263 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  28.95 
 
 
451 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  23.88 
 
 
342 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  36.9 
 
 
320 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  36.9 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  27.88 
 
 
301 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  30.89 
 
 
638 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  26.36 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.9 
 
 
733 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  26.9 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.36 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  32.69 
 
 
256 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  25.58 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  22.89 
 
 
360 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  27.66 
 
 
292 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  25 
 
 
368 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  24.63 
 
 
342 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  33.94 
 
 
476 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  39.08 
 
 
314 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  30 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  29.55 
 
 
337 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
304 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  29.73 
 
 
300 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  28.26 
 
 
259 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  32.11 
 
 
376 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  30.48 
 
 
319 aa  41.6  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  29.63 
 
 
310 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  28.26 
 
 
752 aa  41.2  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 
652 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.77 
 
 
255 aa  41.2  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  22.56 
 
 
345 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>