70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7027 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  44.59 
 
 
326 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  41.21 
 
 
334 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  41.4 
 
 
335 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  34.74 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
349 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1714  hypothetical protein  41.86 
 
 
139 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  30.2 
 
 
297 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  33.71 
 
 
208 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  29.38 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  25.38 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  27.14 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  25.88 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  25.27 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  29.73 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  27.65 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  25.69 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  34.55 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  25.52 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  24.91 
 
 
275 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 
272 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  29.59 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  24.61 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  27.78 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  27.04 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  27.03 
 
 
249 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  26.07 
 
 
308 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  26.73 
 
 
262 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  25.77 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  27.78 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  23.29 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  24.87 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 
264 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  32.14 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  27.32 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  27.49 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  25.81 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  26.73 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  31.62 
 
 
237 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  29.5 
 
 
293 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  29.38 
 
 
218 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  28.78 
 
 
239 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
261 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  26.49 
 
 
275 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.77 
 
 
760 aa  46.2  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  27.74 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  30.56 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  23.05 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  26.6 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  25.24 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  23.78 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  23.11 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  24.89 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  37.5 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  27.72 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  32.03 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  29.32 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.31 
 
 
656 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  26.04 
 
 
245 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.53 
 
 
688 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2606  hypothetical protein  32.35 
 
 
279 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  26.84 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25 
 
 
251 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  25.25 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  37.89 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  26.84 
 
 
243 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>