92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3329 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  30.61 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  32.37 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  32.66 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  32.66 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  30.77 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  26.77 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  31.69 
 
 
331 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.74 
 
 
317 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  25.57 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 
319 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  26.26 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  26.45 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.89 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  26.45 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  25.86 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  30.26 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  29.24 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  28.48 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  32.25 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  25.72 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
317 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  28.35 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  25.97 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  27.11 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  31.56 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  28.31 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  27.42 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.96 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  29.66 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  26.11 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  35.33 
 
 
580 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  25.77 
 
 
460 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  29.22 
 
 
498 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  26.46 
 
 
436 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  25.58 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  24.71 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  23.55 
 
 
309 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  22.91 
 
 
512 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.95 
 
 
259 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  22.74 
 
 
512 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  23.63 
 
 
442 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.57 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  22.08 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  25.48 
 
 
485 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  24.23 
 
 
460 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  24.83 
 
 
460 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  29.81 
 
 
423 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  24.49 
 
 
460 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  24.57 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  24.57 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.73 
 
 
474 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  24.49 
 
 
460 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  24.23 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  26.09 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.64 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.64 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  25.16 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  24.32 
 
 
517 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4242  hypothetical protein  33.04 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  28.1 
 
 
208 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  27.78 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  27.59 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  24.41 
 
 
460 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  26.02 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  20.24 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32.12 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  24.92 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  29.3 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  29.75 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.89 
 
 
263 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  28.36 
 
 
239 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 
262 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
250 aa  42.7  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.48 
 
 
292 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>