95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1232 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
305 aa  614  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  44.24 
 
 
316 aa  235  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  42.66 
 
 
315 aa  232  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  41.58 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  39.17 
 
 
319 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
320 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  38.31 
 
 
424 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  40.57 
 
 
323 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  39.57 
 
 
327 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 
320 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
320 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  38.59 
 
 
308 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  37.99 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  39.37 
 
 
343 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
319 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  37.46 
 
 
330 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  37.13 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  34.51 
 
 
302 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  34.8 
 
 
307 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
315 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  28.85 
 
 
337 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  27.88 
 
 
342 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  27.71 
 
 
339 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  27.88 
 
 
341 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  27.39 
 
 
338 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  27.65 
 
 
320 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  27.24 
 
 
337 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.56 
 
 
317 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  26.76 
 
 
580 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  27.7 
 
 
436 aa  82.4  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  27.67 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  25.97 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  25.71 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.95 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.95 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  26.28 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  23.46 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  28.24 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  28.24 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  28.57 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  29.35 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  26.19 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  28.52 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  26.67 
 
 
434 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.62 
 
 
518 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  27.27 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  25 
 
 
498 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  26.32 
 
 
517 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  24.37 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  23.47 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  25.08 
 
 
474 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  28.09 
 
 
460 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  26.99 
 
 
460 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  35.4 
 
 
390 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  26.67 
 
 
460 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  26.67 
 
 
460 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  30.25 
 
 
473 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  26.67 
 
 
460 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  26.52 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  19.56 
 
 
465 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  24.34 
 
 
460 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  21.91 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  24.39 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
260 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  20.33 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.63 
 
 
286 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  38.33 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  21.48 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  23.29 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  21.98 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  25.31 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  24.39 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  24.39 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11180  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01760)  24.84 
 
 
559 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0975397  normal  0.68223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>